يكون للمجلس فرع في كل محافظة يشكل كل منها من عشرة اعضاء على الاقل، من بين الشخصيات العامة ذوي الخبرة في شئون المرأة والشأن العام في المحافظة، يصدر بتشكيله قرار من رئيسة المجلس بعد موافقة المجلس لمدة سنتين قابلة للتجديد على أن يتم تجديد ثلث الأعضاء سنوياً ويكون لكل فرع أمانة فنية يشرف عليها مقرر الفرع . 

اختصاصات فروع المجلس بالمحافظات تنفيذ التوصيات الصادرة عن المجلس، دراسة الصعوبات والمعوقات التي تواجه تنفيذ سياسة المجلس وتوصياته في المحافظة، واقتراح الحلول اللازمة بشأنها، متابعة وتقييم سياسات التنمية المتعلقة بالمرأة بالمحافظة واقتراح السياسات والأساليب الملائمة لإدماج المرأة في برامج التنمية بها، عقد الندوات والدورات واللقاءات وحلقات النقاش حول الموضوعات التي تخص المرأة، وبصفة خاصة ما يتعلق بمجتمع المحافظة. ما تحيله رئيسة المجلس من موضوعات أخرى . 

تختار رئيسة المجلس مقررة الفرع ومقرر/ة مناوب يتوليا مسئوليتهما من أول اجتماع وذلك لمدة عام قابل للتجديد، وتختص مقرر الفرع بتنفيذ قرارات الفرع ، والإشراف العام على الأمانة الفنية وشئون العاملين والشئون المالية والإدارية للفرع و ما يحال اليها من المجلس.